En la temporada 2011/12, tras la renovación por un año más del acuerdo de filialidad firmado entre ambos clubes en el verano de 2010, el equipo filial bajo la denominación de Burgos B Bupolsa, camisetas de alemania quedó en el puesto 16.º del grupo VIII de la Tercera División. Firma un convenio de colaboración con otro club de la ciudad, el CD Universidad de Burgos, club que esta misma temporada compite en la misma categoría que estaba el filial, camiseta de españa 2022 la Primera División Regional Aficionados.
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